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CRISPR那些事儿

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FAQ

基因干扰(Gene Knockdown)是顺利获得小RNA分子(如siRNA、shRNA)或CRISPRi系统部分抑制目标基因表达的技术:
siRNA/shRNA:siRNA与细胞内的RISC复合体结合,降解靶标mRNA,阻断蛋白翻译。
CRISPRi:改造的dCas9蛋白结合gRNA后阻断基因启动子,抑制转录(不切割DNA)。
适用场景:基因功能研究、疾病机制解析、药物靶点验证。
siRNA: 瞬时效应(5-7天),适合短期表型检测。
shRNA/CRISPRi: 筛选稳转株➡永久性抑制(传代20代以上仍有效)
技术类型 适用场景 交付形式
siRNA转染 快速验证(72-96小时效果) 快速验证(干扰后细胞/实验报告)
shRNA病毒载体 长期抑制(稳定株筛选) 病毒颗粒/稳转株细胞
CRISPRi 高特异性、抑制(i)基因 dCas9细胞系+gRNA载体
参数 siRNA shRNA(病毒载体) CRISPRi
作用周期 瞬时(5-7天) 长期(可稳定传代) 长期稳定
细胞适用性 易转染细胞 广谱(包括难转染细胞) 需要构建dCas9细胞系
脱靶风险 中-高 极低
用途 快速验证 动物/细胞模型 高精度调控
选择建议:
快速验证: siRNA。适用于在易转染细胞中快速测试1-2个基因的功能,成本低速度快。
建立稳定敲低细胞系或体内基因沉默: shRNA (病毒递送)。技术成熟,能实现长期稳定沉默,广泛用于构建细胞模型和动物模型。
高特异性、低脱靶、可逆调控、多基因操作、非编码RNA靶向: CRISPRi (病毒递送建立稳定株)。
EVO视讯 EVO真人生命基因全新升级第七代Bingo™ Prime Editing (PE7),优化编辑蛋白和RNA编辑活性。对比第五代PE技术,点突变成功率和基因编辑效率显著提升,全球知名院校博士专家团队一对一服务。
稳转株和瞬转株的主要区别在于基因表达的持续时间和稳定性:
瞬转株—目标基因在细胞内短暂表达,通常持续数小时到数天,适用于短期实验。
稳转株—目标基因稳定整合到细胞基因组中,能够长期表达,适用于长期研究和生产。
诱导多能干细胞(iPSC)是一类顺利获得将成体细胞重新编程为多能状态的细胞。它们具有类似于胚胎干细胞的特性,能够分化为体内的几乎所有细胞类型。这种技术允许科学家在体外生成各种细胞类型用于研究和治疗,而不需要使用胚胎干细胞。
细胞选择可以遵循以下原则:
1)与研究目的相符
2)sgRNA文库靶向的基因要与细胞的属源相符
3)细胞可以稳定传代
4)转染效率高
尽量不选用原代细胞。由于原代细胞无法稳定传代,可能在文库筛选实验的过程中,原代细胞已经出现大量死亡,无法完成实验。如果选用原代细胞进行文库筛选,为分析决上述的风险,可以顺利获得降低细胞覆盖度和选择gRNA数较小的文库进行筛选,尽可能降低文库细胞池的数量和缩短实验周期。
报告细胞系是顺利获得稳定表达报告基因,用于指示特定基因转录活性或信号通路状态的功能性细胞模型。
可根据研究目标定制特定信号通路、启动子或报告基因组合的报告细胞系。
主要应用于信号转导机制研究、基因调控分析、受体-配体相互作用研究以及药物筛选与功能验证。
常见报告系统包括荧光素酶(Luciferase)和荧光蛋白(如 GFP、RFP),可根据实验需求选择不同检测方式。
经验证的稳定报告细胞系在多代传代中可保持一致的信号响应,适用于定量和比较分析。
支持生物发光成像
  • 稳定表达
  • 数据一致性高
  • 适合长期实验
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